Ich hatte die Prüfung am 16.8.2020 um 11:30

Einstiegsfrage: Warum haben so viele Medikamente Carboxyl und Amino Gruppen
Antwort: Sie sind sehr polar und daher gut bioavailable.
Fragt nach: wieso bioavailability und polarity wichtig sind
Ich: Das sie in das Blut aufgenommen werden, nicht ausfallen,... (er wollte aber einfach wissen das es die soluability erhöht)
Er: what else can you tell me about carboxylic acids and amino groups?
Ich: Sie sind auch an hydrogen bonding beteiligt.
Fragt nach: hydrogen bonding sind nicht die ersten Interaktionen die einem dazu in den Sinn kommen.
Ich: machen auch elektrostatische Interaktionen,
Er: warum machen sie elektrostatische Interaktionen?
Ich: können geladen sein, und dann machen sie die elektrostatischen Interaktionen
Er: Wann machen sie diese Interaktionen?
Ich: wenn das binding pocket auch eine geladene AA aufweist.
Er: aber von was hängt es ab ob sie geladen sind oder nicht?
Ich: pKa und pH. Ich sagte noch, dass eine Amino Gruppe einen pKa von 9 hat und die Carboxylgruppe einen von 4/5. (Ich wusste nicht auf was er aus will, er hat dann gefracht welchen pH unser Körper hat: 7.4 und ich sagte, dass es darauf an kommt in welchem Gewebe das Medikament ist ob die Gruppen geladen sind oder nicht. Ich weiss immer noch nicht was er bei dieser Frage genau hören wollte)

Ich musste Phenylalanin aufzeichnen

Frage: natürliche Produkte werden oft als lead genommen, was sind die Schwierigkeiten
Ich: Sind sehr komplex, schwierig zu synthetisieren.
Er: und wie umgeht man dies?
Ich: semisynthetische Vorgehensweise

Er: beschreibe HTS und auf was testet es?
Ich: Man hat eine library mit verschiedenen substances und schaut, welche Moleküle an das target binden. Man testet auf affinity und selectivity
Er: why does a drug have to be selective?
Ich: damit es keine off target toxicity gibt
Er: gibt es auch on target toxicity?
Ich: Ja
Er: beschreibe on und off target toxicity
Ich: off target: Nebenwirkungen aufgrund Bindung zu einem anderen target, on target: Nebenwirkung aufgrund Bindung an das eigentliche Target an in einem anderen Gewebe
Er: kann man durch HTS auch auf die Struktur schliessen?
Ich: Ja aber normal macht man es mit Cocristalisation
Er: wie kann man darauf schliessen
Ich: die Strukturen der hits vergleichen
Er: aber diese strukturen sind sehr verschieden. was ist ein pharmacophore
Ich: funktionelle Gruppen, die an der Bindung in die active site beteiligt sind, diese sollten bei den hits relativ ähnlich sein. Die auxophoren Gruppen unterscheiden sich
(Er war mit allem nicht so zufrieden, ich weiss nicht was die Antwort dazu gewesen wäre, wie man auf die Struktur schliessen kann)

Er: zeigt mir eine Struktur und will wissen wie sie Metabolisiert werden kann
Ich: durch Oxidation
Er: was kann oxidiert werden und zu was wird es? (-OH wird zu =OH, R-S-R wird zu R-S(=O)-R, er wollte natürlich die Namen der Funktionellen Gruppen wissen)

[b]Hauptthema: Antibiotika[/b]

Er: zeigte mir Salvarsan und ein anderes Antibiotikum und wollte wissen was es sind (waren unbeschriftet)
Ich: Antibiotika
Er: wieso
Ich: wusste nicht was sagen da sie keinen betalaktamase ring hatten und auch nicht wie cephalosporine aussahen
Er: was ist ungewöhnlich an der Struktur von Salvarsan
Ich: ist sehr symetrisch und die Bindung zwischen den aromatischen Ringen ist ungewöhnlich
Er: was ist das As?
Ich wusste es nicht und ratete eine AA, doch es war Arsen
Er: zeigte mir ein betalaktam inhibitor und wollte wissen was es ist
Ich: beta lactam inhibitor
Er: an was erkennt man es
ich: beta lactam ring
Er: was macht die beta lactamase
Ich: bacterien produzieren es damit die beta lactame nicht mehr wirken. die inhibitoren blockieren die beta lactamase, sodass die beta lactame wirken können (Er unterbrach mich, ich habe glaube ich zu viele ähnlich Wörter in einem Satz verwendet, dass man nicht mehr wusste was es soll. Er sagte einfach, dass die betalactamase den beta lactam ring spaltet.)

Er: Ich habe in den Vorlesungen 5 mechanismen gezeigt, an denen Antibiotika angreifen können
Ich: inhibition of cell membrane synthesis, transcription und protein formation (habe nur 3 sagen müssen da der Wecker dann klingelte)

Er: zeigt mir eine Struktur von einem Penicillin analogon und Fragt welche AA darin zu finden sind
Ich: Valine und Cysten (Er: ja immer, wenn ein schwefel darin ist, ist cystein beteiligt)