15:30-15:45 online

Enter the zoom meeting, show the student ID.

They show the two topics: serum sickness and production systems

Halin:
What do you understand under serum sickness?
-I started with the historical part, how they transferred serum between animals and then from horses to humans (diphtheria), it is classified as a type III hypersensitivity reaction (mediated by IgG antibodies).
What else in the serum (other than horse antibodies) could we make antibodies against?
-proteins present in the blood, the most abundant is albumin
Time course of the immune reaction?
-BCR binds the antibody, internalizes it, presents a peptide on MHC II, activates T cell (CD4), T cell activates B cells, polyclonal response (different B cells make antibodies with different specificities against the same antibody), it takes about a week to develop antibodies; the own antibodies bind the horse antibodies and create a big immune complex
How is this immune complex cleared?
-complement activation; transfer to spleen and phagocytosis (she wanted a quite precise answer here and helped me get to it)
What are the symptoms of serum sickness? (where do the immune complexes go/accumulate?)
-she helped me with the comparison to SLE: rash, painful and inflamed joints, kidney damage (checked by urine test - what do you check for? - proteins and blood)
Compare/contrast with contact hypersensitivity?
-priming stage: antigen is present at low doses, taken up into APCs, goes to lymph nodes, presentation to T cells -> by the time the T cells get to the contact site, the antigen may not be present anymore (short exposure, unlike with IgGs which stay in blood for a long time); response to the antigen only happens at a later exposure

Neri:
Name the most important production systems:
-E.coli, yeast, mammalian cells
Production in E. coli: what do you need for it?
-non-pathogenic strain, plasmid - gene of interest, downstream of a promoter e.g. lac, IPTG can be used to switch on production, antibiotic resistance gene
What products can you produce in E.coli and which can you not?
-in general: good for simple folding/structure, non-glycosylated, e.g. insulin; not good for mAb (complex folding, glycosylation)
We saw that insulin has the A and B chain - how do you produce it in E.coli?
-either you produce the 2 chains individually and then the disulfide bonds are formed (in the periplasmic space!) or you produce a precursor and cleave parts of it
Stable vs. transient expression?
-stable: integrated into chromosomal DNA, not lost after proliferation, large yields, low flexibility, used in industry ... ; transient: gene stays extrachromosomally, lost after cell divisions (he stopped me before I listed more)
When you stably integrate a gene, can you just use it to produce your product or what do you need to do before?
-you have to show that the cells can produce the protein, use chemically defined media (was not sure what exactly he meant, so I just started listing what I remembered, he interrupted me for the next question)
Are the cells really monoclonal?
-mammalian cells are not, they can have different karyotypes (he said yes, and also can produce different yields - but the product can be the same)

I think this is everything.
They are very nice, Halin gave hints to help me to get to the answers she wanted to hear, and Neri interrupted me when he has heard what he wanted, when he wanted to ask a follow-up question or move on to the next one.

Good luck!

31.1.21, ONLINE

8:45-9:05 (wir haben etwas früher angefangen, aber es ging trotzdem fast bis 9:05)

Teil Schibli:

Er teilt ein Bild, ich soll beschreiben was ich sehe: man sieht das Skelett (einmal von vorne, einmal von hinten), Gelenke und Wirbelsäule viel intensiver.
Was für ein bildgebendes Verfahren könnte es sein? -> SPECT, mit 99mTc-MDP Tracer (weil Anlagerung an Knochen);
er meint das ist richtig, nur dass es 2D ist und wie heisst es dann -> Szintigraphie;
dann noch wofür steht SPECT
Was könnte der Patient aufgrund dieses Bildes haben? -> weil es am meisten Gelenke waren die man intensiv gesehen hat meinte ich Entzündung, bin letztendlich aud Arthritis gekommen
Warum lagert sich der tracer genau dort so viel an? -> vermehrte Durchblutung
Warum lagert sich das 99mTc-MDP an den Knochen auf? -> es geht an das Hydroxiappatit, weil es ein Phosphatanalogon ist
(99mTc-MDP zeichnen als Hilfe für diese Frage)
welche Tracer lagern sich noch an Knochen an und warum? -> NaF, OH- analogon (er wollte noch eins hören, wäre das 223Ra2+ gewesen als Ca2+ analogon)

Teil Mu:

Give me a summary about CNS tracers -> 4 categories of tracers (misfolded proteins ist mir nicht mehr eingefallen, dann meinte sie: go through the categories one by one – ich habe zu jeder Kategorie Beispiele von Tracern und Anwendung genannt); biol. tracers, examples are raclopride for D2 receptor and cocaine derivatives for DAT; metabolic tracers: FDG for hypometabolism in AD, F-DOPA for AADC activity & PD imaging, FET for upregulated amino acid transport in tumors; perfusion: HMPAO and ECD for stroke
(Die Frage war sehr offen und sie hat kaum Zwischenfragen gestellt, ich glaube nur ein-zwei zur Anwendung von den Tracern. Ich fand es schwierig einzuschätzen wie viel ich sagen sollte und ob sie mit den Antworten zufrieden war, habe einfach alles gesagt was mir eingefallen ist.)
Draw F-DOPA, how do you produce it? -> aromatic nucleophilic substitution (falsch);
sie hat dann versucht mich auf die Antwort hinzulenken und hat gefragt: is OH electron withdrawing or electron giving -> electron giving, what about CN und NO2? -> electron withdrawing; ich habe es anders herum gesagt und sie hat mich erst am Ende korrigiert (sie hat bei dieser Frage nicht nachgegeben, leider ist OC nicht so meins);
letztendlich habe ich mich dann erinnert dass F-DOPA durch electrophilic labeling or copper mediated fluorination hergestellt wird und habe es noch am Ende gesagt

Den Teil mit Herr Schibli fand ich ziemlich angenehm, der Teil mit dem Bild hat sich eher wie eine Diskussion als eine Prüfung angefühlt, und er nickt oder sagt wenn die richtige Antwort bzw. das was er hören will fällt.
Der Teil mit Frau Mu hat mich etwas verunsichert, weil sie die erste Frage so offen gestellt hat und kaum kommentiert hat oder hints gegeben hat.

Ich hoffe das hilft euch beim Vorbereiten, viel Erfolg!